10多年来，该项目对我国北方重要海水养殖鱼类遗传资源发掘和应用技术进行了系统深入的研究，建立了我国海水养殖鱼类遗传资源发掘和应用的技术平台，在种质创制、文库构建、重要性状相关基因和分子标记筛选、分子育种技术建立等方面取得多项原创性成果，主要包括：

（1）构建了半滑舌鳎、大菱鲆等鱼类cDNA文库6个，测定了16000多条EST序列；首次建立了半滑舌鳎BAC文库2个，获得55,296个克隆。

（2）克隆了大菱鲆、真鲷、半滑舌鳎等鱼类的免疫抗病相关基因、性别相关基因或生长相关基因，并对其中30多个基因进行了特征分析和表达研究。

（3）发明了MSTN基因打靶载体构建方法；对大菱鲆抗菌肽和IGF等基因进行重组表达，获得了具有抗菌活性的重组抗菌肽以及具有促生长活性的重组IGF多肽。

（4）首次突破半滑舌鳎亲鱼培育和人工催产繁殖技术难关，首次建立了半滑舌鳎苗种规模化培育技术，开发了新的海水养殖鱼类。

（5）首次筛选到半滑舌鳎和圆斑星鲽雌性特异AFLP标记9个；创建了遗传性别鉴定的PCR技术。

（6）发明了半滑舌鳎性逆转诱导方法，创建了分子标记辅助性别控制技术，将半滑舌鳎苗种的雌性比例提高到70%左右，比普通苗种雌性比例高出20%以上。

（7）首次构建了半滑舌鳎遗传连锁图谱，并将1个雌性特异标记定位在5号连锁群上。

（8）首次筛选到牙鲆和大菱鲆抗病相关MHC基因标记，发明了抗病基因标记选择育种方法，培育出成活率提高30%以上的牙鲆抗鳗弧菌病苗种。

（9）构建了半滑舌鳎等32种海水鱼类微卫星富集文库， 筛选到多态性微卫星标记800多个，其中16种海水鱼类的微卫星标记为我们在国内外首次报道。

（10）发明了海水鱼类SNP标记筛选新方法，并在半滑舌鳎和大菱鲆中进行了应用。

（11）共发表论文114篇，其中SCI论文72篇；申请发明专利15项，其中9项获得发明专利授权。

该项目为海水鱼类良种选育、性别控制、种质鉴定和病害防治提供了基因资源和技术手段；将我国海水鱼类基因资源发掘、种质创制与应用研究提升到国际领先水平。本项目中的多项成果已经进行了推广应用，已累计产生了60多亿元的经济和社会效益。

                               半滑舌鳎雌性特异AFLP标记                            半滑舌鳎BAC文库克隆大小检测