本发明公开了一种三相模块化多电平功率变换系统及其控制方法,包括输入电源,所述输入电源与 N台相并联的三相模块化变换器相并联,每台三相模块化变换器包括三相桥臂,每相桥臂包括上桥臂及下桥臂,且上桥臂及下桥臂结构对称,均包括 n个串联的子模块和靠近中性点的电感,其中每个子模块内包括两个串联的开关管和一个与该两个串联的开关管相并联的电容,每相桥臂的中性点经滤波器连接后并网,每个子模块均与控制器相连;本发明提出的控制策略有效的解决了多台变换器之间的环流问题,通过控制 N1台变换器的零序电流的来实现解决多台变换器之间的环流问题。